NAMD (sur OLYMPE)
Article mis en ligne le 11 juillet 2018
dernière modification le 2 juillet 2020
La version 2.12 de NAMD est installée sur OLYMPE.
- Version CPU
Pour utiliser NAMDEnvironnement avec lequel NAMD a été installé :
- Version GPU
Pour utiliser NAMDEnvironnement avec lequel NAMD a été installé :
Des modèles de script batch sont disponible dans le répertoire /usr/local/namd/2.12-gpu/
.
Un exemple, exemple_script_soumission.sh
, est fourni dans le cas mono-noeud.
Un exemple, exemple_script_soumission_mpi.sh
, est fournit dans le cas multi-noeud.
De plus amples informations sur la soumissions des calculs namd avec GPU sont aussi disponibles sur le site web de NVidia : https://www.nvidia.com/en-us/data-center/gpu-accelerated-applications/namd/.