Gaussian 16 sur GPU

Cet article traite de la version GPU Gaussian 16 B01 Cette version a été compilée dans l’environnement PGI et CUDA :

g16root=/usr/local/gaussian/GAUSSIAN16/B01/g16_gpu_cuda_9.0/ export g16root . $g16root/g16/bsd/g16.profile module purge module load pgi/18.3 cuda/9.0.176.2

Utilisation Gaussian 16 avec GPU

Modifications du fichier .com : nouveaux paramètres %cpu et %gpucpu %cpu liste des cores utilisés lors du calcul %gpucpu liste des GPU et liste des cores contrôlant les GPU

  • Exemple 1 : %cpu=0 core 0 est utilisé %gpucpu=0=0 le GPU 0 est controlé par le core 0
  • Exemple 2 : %cpu=0-1 core 0 et 1 sont utilisés %gpucpu=0-1=0-1 le GPU 0 et le GPU 1 sont contrôlés respectivement par le core 0 et le core 1
  • Exemple 3 : %cpu=0-1,18-19 les cores numéros 0,1 18,19 sont utilisés %gpucpu=0-3=0,1,18,19 les GPU 0,2,3 Et 4 sont contrôlés par les cores numéro 0,1,18 et 19
  • Exemple 4 : %cpu=0-17,18-35 tous les cores sont utilisés (du numéro 0 au numéro 35) %gpucpu=0-3=0,1,18,19 les GPU 0,2,3 Et 4 sont controlés par les cores numéro 0,1,18 et 19

Résultat commande nvidia-smi topo -m :

[@olympevolta0 ~]$ nvidia-smi topo -m
  GPU0 GPU1 GPU2 GPU3 CPU Affinity
GPU0 X NV2 NV2 NV2 0-17,36-53
GPU1 NV2 X NV2 NV2 0-17,36-53
GPU2 NV2 NV2 X NV2 18-35,54-71
GPU3 NV2 NV2 NV2 X 18-35,54-71

Exemples de script slurm :

$ ls -1 /usr/local/gaussian/exemple_script_slurm_g16/ exemple_1cpu_1gpu_script_g16_gpu_test1.slurm exemple_36cpu_4gpu_script_g16_gpu_test1.slurm exemple_4cpu_4gpu_script_g16_gpu_test1.slurm g16_test1_1cpu_1gpu.com g16_test1_36cpu_4gpu.com g16_test1_4cpu_4gpu.com

Voir aussi

Gaussian

Versions installées sur OLYMPE :

G09 sur 36 cœurs

Exemepl de scripts pour utiliser Gaussian version G09 sur 36 cœurs de calcul (Olympe)

Gaussian sur 36 cœurs

Réservation des ressources (Plus d’options ici)