Pour des raisons de besoins mémoire par processus MPI ou de nombre de processus MPI égal à une puissance de 2, il peut être intéressant ou nécessaire de déployer par noeud un nombre de processus MPI inférieur à 36 (sachant que les noeuds d’Olympe dispose de 36 cores physiques).
Attention : la mesure des heures cpu consommées ne tient pas compte du dépeuplement. Le noeud étant alloué de manière exclusive on comptabilise l’ensemble des ressources bloquées (soit 36 cores par noeuds, fois le nombre de noeuds).
Ci-dessous nous traitons une demande pour 512 processus MPI sur 16 noeuds d’Olympe.

Réservation des ressources (Exemple pour 512 tâches MPI sur 16 noeuds, soit 32 processus par noeuds)

Pour autant ce sont les 576 cores physiques des 32 noeuds qui sont réservés par la requête.

Création d’un dossier temporaire de calcul

Votre script à exécuter

• En utilisant IntelMPI #Chargement des modules nécessaires à  l'exécution du script (et uniquement ces modules). Ci-après exemple pour l'environnement par défaut d'Olympe (Intel). module purge module load intel/18.2 intelmpi/18.2 module list srun $(placement 32 1) ./mon_appli.exe > output_${SLURM_JOBID}.log #La commande placement ci-dessus avec les arguments '32' et '1', permet de répartir les 32 processus de manière équilibrée sur les deux sockets du noeud. Le nombre 32 correspond au nombre de processus par noeud, le nombre 1 au nombre de threads par processus (ici 1).

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