Script SLURM pour une réservation de MOINS de 18 cœurs

Réservation des ressources. Deux exemples: Code MPI avec 5 tâches et 10GB de mémoire;  Code Multithreaded avec 5 threads et 10GB de mémoire.

Code MPI. 5 tâches et 10GB de mémoire

Il faut OBLIGATOIREMENT que votre script comporte à minima les informations suivantes (notamment l’allocation mémoire en MB) :

#!/bin/bash
#SBATCH -J script_art610
#SBATCH -N 1
#SBATCH -n 5
#SBATCH --ntasks-per-node=5
#SBATCH --ntasks-per-core=1
#SBATCH --mem=10000
#SBATCH --time=01:00:00
#SBATCH --mail-user=toto [at] mail [dot] com

Dans cet exemple on réserve 10GB de mémoire sur 1 nœud pour lancer 5 tâches durant 1 heure.
Le paramètre time est optionnel mais très important, si on évalue correctement le temps d’exécution on a des chances de passer plus rapidement

La suite du script, en particulier les options de réservation est inchangée par rapport à ce qui est décrit ici

 

Code Multithreaded. 5 threads et 10GB de mémoire

Il faut OBLIGATOIREMENT que votre script comporte à minima les informations suivantes (notamment l’allocation mémoire en MB) :

#!/bin/bash
#SBATCH -J script_art610
#SBATCH -N 1
#SBATCH -n 1
#SBATCH --cpus-per-task=5
#SBATCH --threads-per-core=1
#SBATCH --mem=10000
#SBATCH --time=01:00:00
#SBATCH --mail-user=toto [at] mail [dot] com

# The following variable is REALLY IMPORTANT.
# If the variable is not set up all the threads will run on 1 core
export  SRUN_CPUS_PER_TASK=${SLURM_CPUS_PER_TASK} 

# If the code is OpenMP
export OMP_NUM_THREADS=5

Dans cet exemple on réserve 10GB de mémoire sur 1 nœud pour lancer 5 threads durant 1 heure.
Le paramètre time est optionnel mais très important, si on évalue correctement le temps d’exécution on a des chances de passer plus rapidement

La suite du script, en particulier les options de réservation est inchangée par rapport à ce qui est décrit ici

 

Voir aussi

Script SLURM pour une réservation de PLUS de 18 cœurs

Écrire un script pour un code utilisant plus de 18 cœurs

Réservation des noeuds GPU

Exemple pour 1 nœud et 9 tâches et 1 GPU Il faut OBLIGATOIREMENT que votre script comporte à minima les informations suivantes :