CP2K on Kairos

Le code CP2K est disponible sur kairos.

CP2K on Kairos


CPU-x86

[renon@kairoslogin1 ~]$ module av cp2k
--------------/softs/x86/modulefiles/scientific_applications --------------
cp2k/2025.2-gcc14.1.0-ompi4.1.6  

 

GPU-ARM

#!/bin/bash
#SBATCH --job-name=cp2k-gpu-test
#SBATCH --partition=shared-gpu
#SBATCH --nodes=1
#SBATCH --ntasks-per-node=2
#SBATCH --cpus-per-task=2
#SBATCH --gres=gpu:2
#SBATCH --time=00:20:00
#SBATCH --output=cp2k-gpu-%j.out


module purge
module load cp2k
source $CP2K_SETUP

INP=${1:-${CP2K_HOME}/benchmarks/QS/H2O-64.inp}
srun $CP2K_BIN -i ${INP} -o res.out

Voir aussi

Commandes utiles Conda miniforge ARM

D'abord il faut reserver et se connecter sur un noeud avec la commande suivante avant de creer son environnement:

Gaussian 16 sur Kairos

La version G16 révision B01 est installée sur Kairos ( uniquement sur partition x86)

NAMD

La version 3.0.2 est installée sur Kairos ( uniquement s

GROMACS

La version 2025 est installée sur Kairos ( uniquement sur partition GPU-ARM) avec NVHPC 25.3 

Gaussview (Kairos)

Notebook jupyter sur Kairos

Il est possible de faire un notebook jupyter sur Kairos, à certaines conditions :

Alphafold3

Modélisation avec Alphafold3 sur KairosCette page explique la mise en place du job à partir du répertoire suivant, à récupérer ici :

chdb

In this tutorial, you’ll learn how to use chdb to run your embarassingly parallel computations. All the usecases supported by chdb will be described here.

GAMESS

Chargement du modulemodule purgemodule load gamess/v2024.2.1-oneapi2025